2000er-Jahre
2000
Erstes Open Air im Flon in Lausanne zum Thema « La Ville en ce jardin » (Die Stadt im Garten)
2002
Integration des ehemaligen Filmdokumentationszentrums Zoom in Zürich, das zur deutschsprachigen Niederlassung der Cinémathèque suisse wird
Ausstellung « Autant-Lara, un cinéaste contre tous » im mudac in Lausanne
Veröffentlichung der DVD « Il était une fois … la Suisse »
2005
Auf Antrag von Pascal Couchepin gibt der Bundesrat grünes Licht für den Erwerb neuer Grundstücke in Penthaz
2007
Veröffentlichung von Histoire du cinéma suisse 1966–2000, ein Buchprojekt unter der Leitung von Hervé Dumont und Maria Tortajada, in Zusammenarbeit mit der Universität Lausanne
2008
Nachdem der Bundesrat den Bau eines neuen Forschungs- und Archivierungszentrums beschlossen hat, bewilligt das Parlament einen Verpflichtungskredit von 49,5 Millionen Franken für den Bau in Penthaz
Marc Wehrlin fungiert zwischen zwei Direktoren interimistisch als Delegierter des Stiftungsrats, dessen Vorsitz er 2010 übernehmen wird
2009
Frédéric Maire wird neuer Direktor