Depuis 2002, la Cinémathèque suisse a une antenne en Suisse alémanique avec le Centre de recherche et d'archivage de Zurich. Celui-ci trouve ses origines dans l'intérêt que porte l'Église catholique pour le 7e art. Depuis 1942, l'Église catholique disposait de bureaux à Zurich consacrés au cinéma et publiait la revue spécialisée Der Filmberater. Dans le cadre de cette activité, des dossiers documentaires ont été réunis comprenant des dossiers de presse, des dépliants, des articles de presse ou des photos sur des films et sur des organisations actives dans le domaine. Ces matériaux sont aujourd'hui des sources importantes de l'histoire du cinéma suisse.
Les archives papier constituent un autre point fort important de la collection. Il s'agit des documents de travail que les cinéastes ou les entreprises actives dans la production et dans la distribution déposent afin de les conserver à long terme. Ces archives papier de Zurich documentent notamment le cinéma d'auteurs suisses alémaniques depuis les années 1970 environ. Mais il existe aussi des fonds plus anciens, comme les archives de Praesens Film A.G., une société de production et de distribution dont les activités remontent au début des années 1920.
En outre, la Cinémathèque de Zurich est elle-même active dans le domaine de la numérisation et de la médiation, et coopère avec d'autres institutions cinématographiques et de conservation.